CodonCode Aligner

تفصیل

CodonCode Aligner DNA سیکوینس اسمبلی، الائنمنٹ، کنٹیگ ایڈیٹنگ، اور میوٹیشن کا پتہ لگانے کے لیے صارف دوست سافٹ ویئر ہے۔ Aligner Phred-phrap کے ساتھ مطابقت رکھتا ہے اور ایک واقف، سیکھنے میں آسان یوزر انٹرفیس پیش کرتے ہوئے، ترتیب کے معیار کے اسکور کی مکمل حمایت کرتا ہے۔ خصوصیات میں ٹیکسٹ فائلوں سے درآمدی سلسلے، نشانات کے لنکس کو برقرار رکھتے ہوئے ایک دوسرے سے کنٹیگس کو سیدھ میں لانا، متضاد تغیرات تلاش کرنا، دلچسپی کے علاقوں کی وضاحت کرنا ("خصوصیات")، Phrap سے تیار کردہ اسمبلیاں درآمد اور ترمیم کرنا، برآمدی ترتیب اور خصوصیات، درآمدی ترتیب شامل ہیں۔ ABI اور SCF فائلوں سے، ویکٹر ٹرم، ایک حوالہ ترتیب کے ساتھ سیدھ میں لائیں، heterozygous insertions اور deletions کا تجزیہ کریں، صارف کی وضاحت کردہ خصوصیات کے درمیان نیویگیٹ کریں، اور Consed-compatible اسمبلی پروجیکٹس برآمد کریں۔